证券上市合同纠纷主要有：

  股票上市合同纠纷是指申请股票上市交易的公司与证券交易所之间因股票上市合同的订立、履行、终止等发生的各种纠纷。公司债券上市合同纠纷是指申请上市交易的公司与证券交易所之间就签订的上市合同的成立、履行、终止等发生的各种纠纷。

  证券上市合同纠纷属于合同纠纷，该类纠纷案件的管辖适用合同纠纷案件的管辖的一般原则，根据《民事诉讼法》第23条的规定，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。